Повсеместно распространенное заболевание всходов. В области корневой шейки появляется потемнение, охватывающее всю корневую шейку в виде перетяжки. У пораженных растений корневая система не развивается, листья желтеют, растения отстают в росте, теряют тургор и погибают. Черная ножка вредоносна при возделывании рапса на тяжелых по механическому составу почвах, когда в период всходов из-за большого количества осадков и низкой среднесуточной температуры воздуха на поверхности почвы образуется корка, ограничивающая доступ воздуха к корням растений.